（一）地区倾斜政策的偏差
由于国家实施了不平衡发展战略，以效率代替公平，从而在具体政策上东西部拉开了差距。
（1）沿海一带享受特殊政策，特别是经济特区和开放口岸以及许多高新技术开发区，在财政、税收、投资、外贸、外汇审批权等方面享有内地所没有的特权优惠。
（2）产业政策的倾斜。沿海一带国家鼓励其发展劳动密集型企业，如轻工业、加工业等，这些产业投资少，见效快，且便于出口。而中西部主要是能源采掘、重工业，自然在转轨时期缺乏竞争活力。
（二）中部地区的“经济凹陷”
中部经济有“凹陷”之忧。自20世纪80年代初沿海发展战略和20世纪90年代末西部大开发战略的实施，中部地区已成为全国的“经济凹地”，十六大后又提出“支持东北地区等老工业基地加快发展和改造”的方针，中部地区经济地位相对下降。中部地区农业比重很大，农村人口过多，由于靠农业发展的出路越来越窄，而制造业又没有出现由东部向中部转移的梯度效应，在东部大发展、西部大开发、东北经济振兴的新形势下，中部地区经济结构转型所面临的国内与国外的压力会加大，“经济凹地”有可能会加深。
（三）“资源换增长”模式
“资源换增长”模式普遍存在。很多地方政府用土地和优惠政策招商引资作为促使本地经济发展和GDP增长的最优选择，这是区域经济可持续发展面临的一个最普遍的问题。
（四）区域产业结构趋同
其主要表现：一是重复建设，这不仅出现在价高利大的产业领域，而且在基础设施领域尤甚。二是在开放引资上竞相出台优惠政策，在外贸出口上竞相压价，导致过度或恶性竞争，甚至区际联系还要小于与国际的联系。三是存在严重的产业同构现象。加速扩大的地带间经济发展差距，加大了地方政府尤其是中西部地区地方政府“兴地富民”的客观压力，迫使一些地方政府在项目投资上置全局性资源浪费、生产能力过剩而不顾，低效益、低水平地重复引进、生产、建设，从而导致地区产业结构趋同现象不断加剧。这不仅抑制了地区经济比较优势的发挥，丧失了地区分工效益和规模经济效益，而且影响国民经济整体效益的提高。
（五）地缘因素
中西部地处内陆，交通闭塞，信息不灵，再加上贫困人口多，人口素质低；而东南沿海地区交通方便，商品意识强，同时，沿海一带非国有经济成分多，竞争活跃，这些地缘因素造成了东西部经济发展差距。
