沪港通推出已经两年多，深港通也于2016年12月5日正式启动。深港通的运作情况与沪港通大致相同，但二者在投资标的股票、影响及作用机理等方面存在不同之处。
（一）投资标的股票不同
深港通和沪港通在投资标的股票上存在不同，深港通下的港股通增加了市值50亿港元以上的恒生综合小型股指数成份股。沪港通与深港通的投资标的、投资门槛、投资额度及交易时间对比详见表1-4。
深市有中小板和创业板，深市的成长股是沪港通和港股市场的补充。相较于沪港通，深港通的投资标的不局限于A/H股同时上市，它包括深证成份股。
表1-4 沪港通与深港通的投资标的、投资门槛、投资额度及交易时间对比
